La historia del monte Ngorongoro comenzó hace unos veinte o treinta millones de años, cuando se formó el gran valle del rift. Los materiales derretidos ascendían a través de las fallas, a lo largo de esa enorme grieta, determinaron la formación de un gran numero de volcanes en toda la región, conocida hoy como LAS CRÁTER DE HIGHLANDS. Hace unos cinco millones de años el Ngorongoro alcanzó su altura máxima 4570m aprox, pero dos milones de años después, la actividad geológica desarrollada se desvio hacia el este y, en consecuencia los volcanes de las Crater Highlands se extinguieron.
Pero este volcán se despertó repentinamente; acompañado de terribles explosiones que lanzaban rocas y cenizas volcánicas. Se creó una gran cámara de magma subyacente. En consecuencia el cono se fue hundiendo y introduciéndose en la cámara vacía. Este hundimiento originó la gran caldera del Ngorongoro: una gigantesca depresión en forma de cráter.
